《金陵十三钗》是真实历史。
《金陵十三钗》的历史原型发生在魏特琳教授执教的金陵女子文理学院，当时魏特琳教授作为南京安全区国际委员会的一员，在金陵女子文理学院里收容了上万名名躲避战乱的妇女儿童，按照委员会的协议，日寇不应该进入女子学院。
但是日寇并不在乎这些协议，魏特琳教授在她的日记里记载，每天都有妇女被闯入校园的日寇侮辱，她赶过去组织，那些日本禽兽也并不将她放在眼里，甚至有会有人拿着枪指着她，哪怕她向那些禽兽出示日本大使馆的文件也没有任何用。
在37年12月24日的日记里，魏特琳教授记载了她和一名日本高级军官会晤，日本军官要求她从女子文理学院收容的上万名妇女之中挑选100名“风尘行业工作者”，让自己的手下“发泄”，这样或许他手下的禽兽们就不会继续骚扰女子文理学院了。
这一段日记便是《金陵十三钗》的原型了，魏特琳教授无奈只能答应了日本军官的要求，因为她实在是保护不了学院了，她任由日本人从她手下收容的万余妇女之中找到了21个曾经从事过风尘行业的女子送了出去，想要以此保护学院里其他的女子。
此后这21个女人的命运就是魏特琳教授不知道了，不过以日寇的禽兽性格，这21个女人的下场显然不会太好，而且魏特琳教授想要保护自己学院里的万余妇女的想法也没有实现。
《金陵十三钗》影片剧情
1937年，日军入侵南京，战火中，六朝古都化为废墟，众多中国军民被困城中。一支十数人的国军德械教导队余部在长官李教官（佟大为饰）指挥下，从日军手中救出了一批教会学校女学生，而李教官等人，至此丧失了出城的机会。
幸免于难的书娟（张歆怡饰）等学生返回文彻斯特教堂，随她们一起来到的，还有受雇远道至此收殓神父遗体的美国人约翰·米勒（克里斯蒂安·贝尔饰）。
此时的南京城中，逃难的人们蜂拥进安全区和教堂寻找庇护，十四名风尘女子强行进入教堂避难，其中精通英语的玉墨（倪妮饰）希望借助约翰的身份为一行人提供更多保护。教堂的墙壁，并不能阻挡日军的铁蹄，教堂内的人们，将面临孰生孰死的选择。
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