第一集的开始发生在四年后，就是Heroes第3季预告片的最后：Claire穿着一身性感的衣服用枪指着Peter，Peter停止了时间，并拿走Claire的枪消失了。 Peter出现在未来，Nathan正要宣布自己的超能力时被Sylar射杀。Peter追Sayler，Parkman也跟了出去。（未来的Peter射杀了Nathan，为了阻止他说说出自己的秘密）Claire在电视上得知了这个消息，她打电话给Peter希望能帮助他，但Peter拒绝了。医院里Nathan正在接受抢救，而Peter在一边等候，似乎看起来已经没有希望了，但Nathan突然从床上起来。片头过后，镜头切回到Hiro，他办公室里无聊，Ando走了进来说Hiro因为拥有了51%的公司和2.5亿美元。Hiro正在发牢骚这时他父亲的律师敲门进来给Hiro一张他父亲留下来的一张关于Hiro命运的DVD盘。Claire正要打算出去，这是Sylar出现了，Clarie打算逃跑，但Sylar用自己的超能力封锁了整个房子。在Claire和sylar斗法的过程中，Sylar似乎比以前更强大了。镜头转向了Maya和Suresh。Maya希望Suresh给她检查，但Suresh并不想，他收拾行李回印度。Suresh发现这些超能力不是因为基因导致的，而是源自肾上腺激素。Hiro看他父亲留下的DVD，将会告诉他一个秘密。这个秘密在他的保险箱里。如果落入坏人之手，将能统治整个世界。他告诉Hiro他的命运不是来打开这个保险柜而是保守这个秘密。Hiro不安于他的现状。他想成为一个英雄，于是打开了保险柜。Hiro的超能力回来了。Parkman看到Peter带着枪，他们俩都在相互使用读心术。Peter告诉Parkman他来自未来，是以前Peter的变种。Nathan 在医院里醒来，当Peter进来的是偶Nathan和他的衣服都不见了。Nathan去了教堂说他看到了上帝，上帝给了他一个机会去做伟大的事情。记者们问他是否准备好演讲。这时看到Peter正要拿出枪。他在教堂对他的家人发表了演讲。他说我们是联系着的，最后他说”Save ourselves, save the world”。他跪下祈祷，当他倒下的时候Peter接住了他。Suresh开始检查Maya，他把Maya的能力以化学的形式剥离出来。他已经掌握了超能力的来源。他说注射可以使每个人获得超能力。又是预告片上的场景，Clarie藏在壁橱里。Sylar在找她，并发现一个装满坏人villains名单文件的盒子。Claire突然出来刺向Sylar，但被Sylar捉到，Claire被开脑了。Sylar研究Claire的大脑，他从她的脑袋里取走了些东西，然后他胸前的伤口开始愈合。Sylar把Claire的头盖骨盖上，当他离开的时候Claire开始愈合。Claire想知为什么Sylar不杀她，Sylar说她并不和别的人一样。他说即使他想他也不能杀死Claire。最后他说Claire和他都将长生不老。Maya希望毁掉注射器疫苗，但Suresh希望他能为人类做有益的事情。Maya认为这些超能力都是诅咒，她说如果这些疫苗不能治愈她，就必须毁掉。Nathan回到医院。Peter给他看报纸上的头条新闻”coached by God” （受上帝教诲），他说这些能力都是再为上帝工作。他认为他们都是天使。听从上帝的吩咐。他不准备把自己的能力公布于众，因为他认为如果每个人都知道了，他就不是天使了。这时Linderman来到病房说他们都在做伟大的事情。 Nikki和纽约市长在一起，当看到Nathan的新闻是说“他是我们的人”。这时镜头切到Parkman（预告片里镜头），他似乎被Peter禁锢在一个空间里。（Parkman因为发现了Peter的秘密而被Peter禁锢）在东京。Hiro想弄明白Speedster（一个神秘的穿越时空的金发女郎，预告片上有Hiro这个镜头）是怎么知道他打开保险箱（之前Hiro不按照他父亲的命令打开保险箱后，取出了里面那个保护世界的formula（配方？），但Speedster抢走了formula。）。Hiro说他将永远不能回到过去。但能回到未来。他看到未来的Hiro和Ando在争吵。他和Ando踏上寻找配方之旅。Sureash在码头处理这些疫苗的时候改变了想法，他把这些含有超能力的疫苗注射进自己的身体。然后突然倒下并全身抽搐。回到医院，Petrelli的母亲指导Peter并不是真正的Peter，并让他回到他的时代去。在地下囚禁有超能力的坏人的地方。一个秃头男说他是Peter Petrelli。这时我们能够看到的Claire的父亲在另一个牢房里。直到看到一个恐龙化石，Parkman才发觉他在被禁锢在思想里。Nikki在病房外看着NathanSuresh醒来，他发现自己也有了超能力，能把枪扭曲，把人仍20英尺远。他站起来，握着手
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