厌氧菌是一类在无氧条件下，比在有氧环境中生长好的细菌，而不能在空气（18%氧气）和（10%二氧化碳）的浓度下的固体培养基表面生长的细菌。这类细菌缺乏完整的代谢酶体系，其能量代谢以无氧发酵的方式进行。
它能引起不同部位的感染，包括阑尾炎，胆囊炎，中耳炎，口腔感染，心内膜炎，子宫内膜炎，脑脓肿，心肌坏死，骨髓炎，腹膜炎，脓胸，输卵管炎，脓毒性关节炎，肝脓肿，鼻窦炎，肠道手术或创伤后伤口感染，盆腔炎以及菌血症等。
抗厌氧菌药物主要为硝基咪唑类，包括甲硝唑和替硝唑等。因为价格便宜，副作用小，不易产生细菌耐药，所以应用广泛，其中甲硝唑使用最多，但细菌对甲硝唑的耐药性也在不断增加。在治疗某些感染性疾病时，有时候即使使用再高级的抗生素，效果也不好，反而导致菌群失调，加重病情，这这种情况可能是因为我们忽视了对厌氧菌的治疗。通过以上描述，治疗厌氧菌最好的药物就是硝酸咪唑类药物，甲硝唑和替硝唑。
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